然后放到GenBank中进行比对

龙中儿
       黄运红
       
       35：378-383.

菌种分离自ga培养基
       在纯化培养基isp 2上菌落呈橘黄色
       通过显微镜可观察到单个孢子着生在基内菌丝上

rrna基因序列的系统发育分析将测序得到的16s rrna基因序列上传到genbank上
       获取genbank号码然后放到genbank中进行比对
       然后从genbank、embl或ddjb上下载相似率高（一般＞98％）的相关菌属的模式菌株（type strain）的16s rrna基因序列
       采用邻接法（neigh-bour joining）构建聚类分析图
       主要软件包括mega 、bioedit
       初步确定菌株分类归属

建立的按照1997年stachebrandt 等建立的新分类系统
       小单孢菌科在放线菌分类中属于细菌域
       放线菌纲
       小单孢菌亚目
       在小单孢菌亚目中只有1个小单孢菌科小单孢菌属作为小单孢菌科的代表属
       于1923年建立
       该属微生物是一类丝状原核微生物
       为革兰氏阳性菌
       兼性好氧
       
       但部分菌株能在ph值为10时生长

【xzbu】郑重

、60 min的预处理
       葡萄糖天门冬素培养基作为分离培养基该菌株革兰氏阳性
       橘黄色基内菌丝
       产单个孢子经16s rrna基因序列分析
       归到小单孢菌属
       并成一独立分支并与m. siamensis tt2-4t的相似率最高
       ％初步判定菌株为小单孢菌属一个潜在的新种

对土壤样品的有机质、全钾、有效磷、有效钾百分比含量及ph值、含水率测定（部分结果由中国热带农业科学院橡胶研究所完成）

恒温培养28 d
       根据平板上菌落的形态特征
       选取平板上所有的代表性菌落
       挑取到isp2琼脂培养基上
       采用三步划线法纯化获得单菌落纯化好的菌株保藏到20％的甘油管中
       置于-20

1的氯仿与异戊醇混合液
       涡旋振荡10 s
       室温静置几分钟
       14g离心5 min上清液即可用作pcr模板
       可通过电泳检测是否含有放线菌的基因组dna

当前所在位置：中国论文网科技论文发表小单孢菌的分离及16s rrna基因序列分析

采用核酸提取仪法提取放线菌的基因组dna
       为pcr扩增提供模板其具体步骤如下：

型主要的甲基萘醌有mk-9
       mk-10或mk-12（h4
       h8）dna的摩尔百分比含量为71%~73%

菌株与其他的小单孢菌属的有效种的16s ％
       其构建的聚类分析树结果显示
       菌株独立于其他的小单孢菌
     ;  为单独的一支
       作为该属的一个潜在新种的可能性非常大近年来
       红树林分离得到一些的新属、新种
       具有丰富的放线菌资源
       （asanoa hainanensis）其中根围小单孢菌、海南野野村菌、海南阿萨诺菌分离自红树植物的根围土壤
       并且根围小单孢菌跟菌株菌分离自同一份样品海膝根围土壤试验结果表明
       菌株是新种的可能性非常大
       需要进一步进行形态、生化及dna杂交的鉴定工作

+9；q78文献标识码a文章编号 1007-

头苑红树植物海漆根围土壤的主要化学成分析结果为：％；％；％；％；％； mg/kg； mg/kg；；盐度40

       60g土壤置于9 ml的1/4格林溶液1/10的稀释液
       超声波处理10 min；然后用1/4格林溶液稀释得到1/100、1/1 000的溶液
       备用

在平皿上直接挑取100 mg菌体到lysinga tube中lysinga tube事先装好小珠子
       并灭菌

徐小雄
       阮继生
       
       36：1299-1304.

采用稀释平板分离法分离菌株
       取1/10、1/1 000稀释液各100

菌株的rrna基因序列的genbank序号为eu
       通过16s rrna基因序列聚类分析树的结果分析
       初步判断菌株归到小单孢菌属
       并且在小单孢菌属里面成为独立的一支进一步分析其与小单孢菌属中有效种的16s rrna基因序列相似率分析
       菌株的16s rrna基因序列与m. siamensis tt2-4t的相似率最高
       ％；
       ％；再次是m. tulba-ghiae tvu1t
       ％由此初步判断
       菌株极有可能是小单孢菌属中的一个潜在新种

       基内菌丝发达
       有隔在基内菌丝上长单个孢子
       孢子不能游动细胞壁含meso-dap 和甘氨酸全细胞水解物含阿拉伯糖和木糖特征性磷脂是磷脂酰乙醇胺、磷脂酰肌醇和磷脂酰肌醇甘露糖苷
       属磷脂p

葡萄糖天门冬素培养基
       葡萄糖均添加了终浓度为50 mg/l的放线菌酮、制霉菌素和重铬酸钾；复合维生素
       每1 mg； mg； mg； mg；